Θέματα Βιοχημείας Ι 2016

(Ιανουάριος 2016)

1.α) Να γράψετε τις ιονισμένες μορφές της ιστιδίνης. Ποιο είναι το καθαρό φορτίο κάθε φορά;
1,β) Να γράψετε την ιονισμένη μορφή της ιστιδίνης σε pH 1.5, 4, 6 και 9. Αν για κάθε τιμή pH βάλουμε την ιστιδίνη σε ηλεκτρικό πεδίο, αυτή θα κινηθεί προς την άνοδο ή προς την κάθοδο. Δίνονται για την ιστιδίνη: pK1 = 1,82 pK2 = 6,00 και pK3 = 9,17.

2. Σερίνη, βαλίνη, γλουταμίνη, λευκίνη, μεθειονίνη, ισολευκίνη, ασπαραγινικό οξύ, γλουταμινικό οξύ, κυστεΐνη – S – S- κυστεΐνη, φωσφοσερίνη:
α) Ποια από αυτά τα αμινοξέα μπορούν να βρεθούν στο εσωτερικό μιας σφαιρικής πρωτεΐνης και ποιά θα προεξέχουν στο εξωτερικό τμήμα της; Αιτιολογήστε. Πού θα βρίσκεται ο δισουλφιδικός δεσμός του διμερούς κυστεΐνης και γιατί;
β) Ποιό αμινοξύ θα μπορούσε να βρεθεί στο Ν – τελικό άκρο της πρωτεΐνης και ποιά στο καρβοξυ – τελικό άκρο;

3. Ποιά η δομή του κολλαγόνου; Βιοσύνθεση κολλαγόνου.

4. Αλλοστερικός έλεγχος λειτουργικών πρωτεϊνών. Τί γνωρίζετε; Αναφέρατε αναλυτικά ένα από τα δύο μοντέλα που έχουν προταθεί για την εξήγηση των αλλοστερικών φαινομένων.

5. Κινητική ενζυμικών αντιδράσεων. α) Σταθερά Michaelis Km: ποιά η φυσική σημασία της; β) Σχεδιάστε το διάγραμμα των επιπτώσεων στην καμπύλη Lineweaver – Burk παρουσία i) συναγωνιστικού και ii) μη συναγωνιστικού αναστολέα.

6. Κύκλος του Krebs: να γραφούν οι χημικές αντιδράσεις στις οποίες συμμετέχουν συνένζυμα. Ποιος ο ρόλος αυτών των συνενζύμων;

7.α) Να γράψετε το συντακτικό τύπο του παρακάτω τρινουκλεοτιδίου pdGpdApdC.
7.β) Σας δίνετε ένα τμήμα DNA, που περιέχει 400 ζεύγη βάσεων. Πόσες βάσεις πουρίνης και πυριμιδίνης περιέχει το παραπάνω τμήμα DNA;

8. Τι είναι υπερχρωμία στο DNA; Τί είναι το σημείο τήξεως του DNA; Τι είναι η χρωματίνη και τι τα νουκλεοσώματα; Τι είναι τα πλασμίδια;